Ontology of Genes and Genomes

Last uploaded: December 2, 2016
Preferred Name

BRCA2

Synonyms

FANCD1

FACD

FAD1

FANCD

PNCA2

BRCC2

BROVCA2

FAD

GLM3

Definitions

Other designations: BRCA1/BRCA2-containing complex, subunit 2|Fanconi anemia group D1 protein|breast and ovarian cancer susceptibility gene, early onset|breast cancer 2 tumor suppressor|breast cancer type 2 susceptibility protein

ID

http://purl.obolibrary.org/obo/OGG_3000000675

comment

Other designations: BRCA1/BRCA2-containing complex, subunit 2|Fanconi anemia group D1 protein|breast and ovarian cancer susceptibility gene, early onset|breast cancer 2 tumor suppressor|breast cancer type 2 susceptibility protein

description

breast cancer 2, early onset

alternative term

FANCD1

FACD

FAD1

FANCD

PNCA2

BRCC2

BROVCA2

FAD

GLM3

chromosome ID of gene

13

database_cross_reference

HGNC:1101

Ensembl:ENSG00000139618

HPRD:02554

MIM:600185

Vega:OTTHUMG00000017411

definition source

WEB: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene

full name from nomenclature authority

breast cancer 2, early onset

gene map location

13q12.3

has GO association

GO_0000724 (EC: IDA); GO_0000724 (EC: TAS); GO_0000910 (EC: IDA, PMID: 17286961); GO_0001556 (EC: IEA); GO_0001833 (EC: IEA); GO_0002020 (EC: IPI, PMID: 15314155); GO_0003697 (EC: IDA); GO_0004402 (EC: IDA, Qualifier: NOT, PMID: 9824164); GO_0005515 (EC: IPI, PMID: 10373512); GO_0005634 (EC: IDA); GO_0005654 (EC: TAS); GO_0005730 (EC: IDA, Qualifier: NOT); GO_0005737 (EC: IDA); GO_0005813 (EC: IDA, PMID: 17286961); GO_0006281 (EC: TAS); GO_0006289 (EC: IMP, PMID: 16845393); GO_0006302 (EC: IMP, PMID: 16845393); GO_0006302 (EC: TAS); GO_0006978 (EC: IEA); GO_0007141 (EC: IEA); GO_0007283 (EC: IEA); GO_0007420 (EC: IEA); GO_0007569 (EC: IEA); GO_0008585 (EC: IEA); GO_0010165 (EC: IEA); GO_0010225 (EC: IEA); GO_0010332 (EC: IEA); GO_0010484 (EC: IDA, PMID: 9619837); GO_0010485 (EC: IDA, PMID: 9619837); GO_0030097 (EC: IEA); GO_0030141 (EC: IDA, PMID: 8589722); GO_0032465 (EC: IEA); GO_0033593 (EC: IDA, PMID: 15930293); GO_0033600 (EC: IDA, PMID: 15930293); GO_0042771 (EC: IEA); GO_0043015 (EC: IPI, PMID: 17286961); GO_0043234 (EC: IDA, PMID: 9774970); GO_0043966 (EC: IDA, PMID: 9619837); GO_0043967 (EC: IDA, PMID: 9619837); GO_0045893 (EC: IDA, PMID: 9126734); GO_0045931 (EC: IEA); GO_0048478 (EC: IEA); GO_0051298 (EC: IMP, PMID: 17286961)

has PubMed association

PMID: 1072445; 7581463; 7597059; 8091231; 8524414; 8589722; 8589730; 8640235; 8640236; 8640237; 8665505; 8673090; 8673091; 8841191; 8895509; 8917547; 9126734; 9126738; 9150152; 9150155; 9405383; 9523196; 9560268; 9609997; 9619837; 9654203; 9774970; 9811893; 9824164; 9971877; 10323242; 10373512; 10486320; 10551859; 10570174; 10608806; 10749118; 10807692; 11039575; 11044354; 11062481; 11063672; 11073541; 11097234; 11130383; 11139248; 11149425; 11158174; 11170288; 11180449; 11181654; 11192759; 11207040; 11207041; 11207365; 11221880; 11239453; 11248061; 11263938; 11313963; 11343905; 11377596; 11403219; 11410514; 11426450; 11433401; 11437399; 11448436; 11466700; 11474660; 11477095; 11481082; 11493753; 11504767; 11505617; 11535547; 11550168; 11556836; 11562929; 11584901; 11597317; 11602572; 11668223; 11698567; 11710890; 11754111; 11786575; 11786581; 11788883; 11793480; 11802208; 11802209; 11807777; 11807889; 11822793; 11844822; 11857015; 11857383; 11857748; 11857749; 11870168; 11870509; 11873550; 11879560; 11883440; 11890937; 11896095; 11897832; 11920551; 11920621; 11927503; 11948477; 11950811; 11953874; 11964925; 11972384; 11977534; 11981002; 11983207; 12020440; 12023992; 12032298; 12036913; 12039933; 12065746; 12070551; 12088120; 12100744; 12101561; 12112655; 12114473; 12125210; 12145750; 12165866; 12181777; 12210341; 12215251; 12220452; 12228710; 12229875; 12229876; 12237285; 12237897; 12242698; 12373604; 12376208; 12376518; 12385017; 12404104; 12431973; 12433008; 12440810; 12442171; 12442273; 12442274; 12442275; 12453858; 12457999; 12459499; 12461697; 12464649; 12470990; 12471628; 12473589; 12474142; 12476445; 12477932; 12484126; 12485194; 12491828; 12496047; 12504628; 12527904; 12543786; 12552570; 12556369; 12567413; 12568865; 12569143; 12606939; 12611452; 12618335; 12619154; 12644538; 12644778; 12655560; 12655567; 12670525; 12672886; 12673354; 12677558; 12684407; 12691152; 12698193; 12704633; 12712470; 12756300; 12771943; 12774040; 12779088; 12798717; 12815053; 12833555; 12845657; 12865453; 12879478; 12883740; 12911720; 12911837; 12915460; 12917199; 12920090; 12927042; 12937835; 12938098; 12942367; 12946038; 12967657; 14499622; 14507240; 14517958; 14519755; 14555511; 14555518; 14572939; 14574155; 14576434; 14580253; 14580256; 14580352; 14581427; 14586320; 14615451; 14623252; 14636569; 14647210; 14647413; 14647419; 14647438; 14648706; 14651845; 14660434; 14662532; 14668548; 14670928; 14673037; 14678969; 14680495; 14709734; 14709740; 14722926; 14732925; 14735173; 14735581; 14746861; 14752193; 14755459; 14761918; 14769635; 14973102; 14984481; 15001356; 15015609; 15026808; 15041722; 15053071; 15053073; 15057823; 15059511; 15065660; 15067026; 15070707; 15073127; 15082902; 15083174; 15084244; 15086724; 15095307; 15104281; 15114373; 15115758; 15116316; 15117986; 15131025; 15131399; 15131400; 15131403; 15138483; 15138485; 15140370; 15140371; 15144764; 15159322; 15168169; 15170666; 15199141; 15217508; 15236312; 15254695; 15265971; 15280188; 15280342; 15284715; 15314155; 15317758; 15319244; 15331870; 15345109; 15365993; 15367553; 15375219; 15519522; 15545966; 15548363; 15559734; 15564800; 15571962; 15576832; 15589605; 15617999; 15635067; 15670748; 15671039; 15721786; 15726604; 15728167; 15733268; 15734731; 15734957; 15800311; 15800615; 15800651; 15805113; 15806175; 15863145; 15880530; 15887246; 15894703; 15900600; 15917310; 15930293; 15930334; 15936476; 15937124; 15967112; 15978801; 15983021; 15986445; 15994883; 15996267; 16003728; 16029503; 16030099; 16032702; 16042582; 16047333; 16049805; 16088935; 16099937; 16118051; 16137751; 16140006; 16168118; 16168123; 16168130; 16176503; 16199546; 16205630; 16214912; 16234515; 16239144; 16257105; 16261400; 16261408; 16271956; 16275750; 16280055; 16284991; 16324400; 16331614; 16369438; 16389418; 16391231; 16417627; 16418514; 16419081; 16434996; 16450717; 16455195; 16456781; 16484695; 16485136; 16537453; 16539696; 16541324; 16563180; 16574953; 16619214; 16621732; 16622123; 16638864; 16644204; 16648044; 16701105; 16712842; 16724247; 16724273; 16728435; 16731627; 16741161; 16754685; 16760289; 16764716; 16768547; 16769276; 16783967; 16792513; 16792514; 16793542; 16825431; 16826315; 16843109; 16845393; 16847550; 16860930; 16886281; 16905680; 16912212; 16914443; 16931905; 16944270; 16949048; 16950820; 16956909; 16998496; 16998498; 16998791; 17000754; 17010055; 17018160; 17018785; 17020472; 17021353; 17061047; 17063265; 17063270; 17080309; 17100994; 17101782; 17113724; 17119064; 17145824; 17145825; 17148452; 17148771; 17151928; 17160431; 17196508; 17200672; 17210933; 17216544; 17217814; 17250666; 17257844; 17262179; 17285126; 17286961; 17289874; 17289875; 17301269; 17307836; 17324252; 17333338; 17333342; 17333343; 17333477; 17341484; 17380889; 17386038; 17397054; 17409195; 17413421; 17416853; 17426707; 17428320; 17428325; 17445839; 17453335; 17470134; 17471561; 17474147; 17497966; 17503080; 17515903; 17515904; 17525332; 17541404; 17549502; 17549625; 17563742; 17565157; 17582599; 17591842; 17591843; 17592676; 17603793; 17603881; 17624602; 17625123; 17625228; 17627006; 17634561; 17635951; 17636422; 17636423; 17636424; 17640379; 17645508; 17657584; 17661168; 17664283; 17673924; 17683622; 17686308; 17686574; 17688236; 17700570; 17724471; 17761984; 17767707; 17850627; 17851763; 17898070; 17899372; 17917796; 17922257; 17924331; 17925560; 17940634; 17945002; 17952592; 17968145; 17972172; 17972177; 17977515; 17997147; 17999359; 18024013; 18026875; 18029348; 18034184; 18036394; 18042939; 18043900; 18045956; 18059333; 18060494; 18086758; 18092194; 18095154; 18095987; 18097605; 18098285; 18158280; 18165636; 18167127; 18172190; 18172292; 18175183; 18175216; 18176857; 18178637; 18182601; 18182994; 18200524; 18204050; 18212739; 18214034; 18256760; 18257128; 18258506; 18263878; 18270339; 18279628; 18283561; 18284688; 18285832; 18286383; 18288416; 18307534; 18312450; 18317453; 18327210; 18342932; 18355772; 18363094; 18375895; 18377429; 18380995; 18393245; 18402691; 18406329; 18413372; 18429825; 18431501; 18431737; 18431743; 18434071; 18437078; 18439040; 18439106; 18439109; 18445692; 18451181; 18451254; 18463975; 18465347; 18481196; 18483851; 18489799; 18497862; 18501021; 18509731; 18513387; 18523885; 18528753; 18543099; 18553220; 18559571; 18559594; 18563556; 18574689; 18577985; 18579371; 18593900; 18597679; 18604178; 18618591; 18627636; 18632222; 18642075; 18645608; 18663943; 18676680; 18679827; 18694767; 18703817; 18710587; 18712473; 18717684; 18752448; 18758995; 18765668; 18769160; 18776644; 18779604; 18779615; 18783588; 18794105; 18797466; 18807178; 18819001; 18830263; 18841560; 18842997; 18844490; 18855126; 18936947; 18940471; 18950845; 18955455; 18990703; 18990759; 19009954; 19010876; 19011769; 19011960; 19012002; 19012493; 19016756; 19030985; 19035463; 19047179; 19064572; 19064968; 19066131; 19070627; 19082709; 19083511; 19087709; 19116388; 19124506; 19125001; 19139771; 19165595; 19170196; 19176389; 19179552; 19188187; 19189213; 19190154; 19200354; 19200971; 19214744; 19226467; 19229607; 19232099; 19237606; 19241424; 19253839; 19258476; 19258944; 19267246; 19268590; 19277124; 19288190; 19298662; 19303847; 19307946; 19329713; 19338682; 19340607; 19351817; 19353265; 19369211; 19370414; 19372713; 19377795; 19383373; 19383374; 19383375; 19383376; 19454451; 19473207; 19478387; 19491284; 19491894; 19499246; 19530235; 19536092; 19540122; 19543244; 19548527; 19549808; 19549900; 19553641; 19553677; 19564533; 19573080; 19578754; 19584075; 19584259; 19584272; 19584580; 19597986; 19606050; 19609323; 19609668; 19616529; 19617217; 19619314; 19620486; 19625176; 19626602; 19628690; 19642207; 19644020; 19649554; 19649703; 19649760; 19654294; 19656163; 19656164; 19656415; 19656774; 19661089; 19661094; 19669600; 19690177; 19692168; 19704162; 19707196; 19709076; 19714462; 19715467; 19737859; 19745749; 19748364; 19752737; 19773279; 19780858; 19787003; 19789190; 19795125; 19798417; 19802015; 19805903; 19818997; 19841329; 19843326; 19850743; 19851859; 19858402; 19861517; 19863560; 19875889; 19876733; 19877382; 19877752; 19885732; 19898224; 19899408; 19902366; 19903338; 19913121; 19920816; 19921428; 19941167; 19949853; 19956635; 19996028; 19996031; 20010525; 20020529; 20033483; 20033769; 20043088; 20059483; 20077502; 20104584; 20107607; 20130978; 20134318; 20135344; 20135345; 20135348; 20151938; 20174566; 20180014; 20180971; 20195775; 20199546; 20202217; 20204502; 20206018; 20215531; 20215541; 20216074; 20219108; 20221693; 20232139; 20234119; 20234365; 20301425; 20301471; 20301534; 20301575; 20306497; 20309627; 20332121; 20337906; 20353281; 20356927; 20361264; 20368571; 20373018; 20376556; 20378615; 20380699; 20383578; 20383589; 20396944; 20406939; 20411314; 20411323; 20418484; 20421506; 20422428; 20434624; 20443055; 20450923; 20452659; 20453000; 20455026; 20458532; 20459916; 20472656; 20473725; 20482762; 20496165; 20507642; 20512419; 20513136; 20513533; 20522537; 20535403; 20537530; 20541936; 20549370; 20567915; 20570322; 20579331; 20587610; 20589654; 20606085; 20609467; 20609468; 20610542; 20614180; 20617377; 20625126; 20625817; 20628086; 20638925; 20644561; 20644999; 20652397; 20652400; 20665887; 20676756; 20677014; 20683152; 20694749; 20713847; 20721735; 20721742; 20721747; 20721749; 20722102; 20729832; 20729858; 20729859; 20730487; 20731661; 20733129; 20736950; 20798986; 20804917; 20807450; 20809262; 20809358; 20813000; 20840664; 20842456; 20850175; 20859677; 20871615; 20872766; 20877358; 20878484; 20878485; 20919953; 20924075; 20927582; 20936109; 20950396; 20960027; 20960228; 20972632; 20978178; 21042765; 21060860; 21063910; 21076401; 21079137; 21084279; 21118973; 21119070; 21119368; 21123638; 21135251; 21139048; 21148102; 21149333; 21156238; 21161372; 21190077; 21204799; 21206239; 21221768; 21222048; 21232165; 21276604; 21278312; 21318380; 21324516; 21336636; 21356067; 21378390; 21391735; 21394826; 21399666; 21409565; 21424757; 21425892; 21427728; 21441901; 21476145; 21487248; 21499684; 21514447; 21517277; 21520273; 21555554; 21557934; 21565612; 21573016; 21593217; 21597964; 21598239; 21601571; 21614564; 21637299; 21643751; 21649643; 21653198; 21665305; 21670257; 21670699; 21708937; 21710692; 21719596; 21731065; 21733824; 21735045; 21750719; 21761160; 21769658; 21789034; 21798026; 21890473; 21898151; 21918853; 21918854; 21934105; 21939546; 21945552; 21952622; 21958427; 21974800; 21978880; 21984204; 21987080; 21989927; 21990299; 21993507; 22009639; 22019625; 22034289; 22044689; 22053997; 22072393; 22113258; 22126563; 22133571; 22142662; 22143498; 22144499; 22158906; 22179631; 22187435; 22193042; 22194698; 22212556; 22228431; 22252303; 22252577; 22253870; 22262156; 22274685; 22282309; 22293751; 22339411; 22344029; 22366370; 22382806; 22399190; 22401979; 22406760; 22425664; 22425665; 22429596; 22430266; 22430443; 22434521; 22443199; 22447567; 22476849; 22513257; 22535016; 22569005; 22579622; 22579790; 22586318; 22614657; 22632462; 22645136; 22652532; 22655046; 22666503; 22673632; 22678057; 22680617; 22682623; 22684231; 22710074; 22729394; 22734169; 22736296; 22739995; 22744338; 22752604; 22753590; 22753899; 22768030; 22771033; 22788243; 22789542; 22798144; 22809218; 22829013; 22895246; 22901131; 22915752; 22923021; 22962691; 22967960; 22970155; 22972572; 22984553; 23011509; 23035815; 23038782; 23050611; 23057551; 23066998; 23071527; 23082475; 23096105; 23110154; 23146383; 23146957; 23149936; 23165508; 23184082; 23231788; 23232696; 23233716; 23249957; 23257159; 23262210; 23265709; 23271408; 23284877; 23299404; 23319376; 23320992; 23326384; 23364291; 23370825; 23409019; 23409121; 23411475; 23414920; 23415752; 23420552; 23451180; 23469205; 23483928; 23528734; 23535729; 23535733; 23544012; 23548269; 23562522; 23567481; 23569316; 23585894; 23615136; 23658460; 23678008; 23683081; 23697973; 23704879; 23704984; 23706288; 23711090; 23747895; 23754601; 23767878; 23788249; 23810788; 23846919; 23857704; 23867999; 23918944; 23928241; 23929434; 23935836; 23941904; 23957571; 24013206; 24081944; 24140203; 24145348; 24217135; 24289229; 24519767

label

BRCA2

modification date

20140408

NCBI GeneID

675

NCBI LocusTag

RP11-298P3.4

nomenclature status

Official from a nomenclature committee

organism NCBITaxon ID

9606

prefixIRI

OGG:3000000675

prefLabel

BRCA2

symbol from nomenclature authority

BRCA2

term editor

Bin Zhao, Yue Liu, Oliver He

subClassOf

http://purl.obolibrary.org/obo/OGG_2060009606

Delete Subject Author Type Created
No notes to display